电子散热器不怕酸腐蚀，但是却容易发生碱腐蚀和氯离子腐蚀，所以当一个供热系统的水质呈碱性的时候(PH值高于7)、或氯离子含量比较高(含盐量大)时，散热器就会存在腐蚀漏水的隐患。
另外因为目前国内铝合金的焊接性能不是很好，所以建议消费者避免选用了带焊缝的铝合金散热器，而选购全压铸的铝合金散热器的话，以免焊缝处漏水从而引起财产损失。需要提醒的是：由于铝合金散热器对水质的要求与钢不一样，所以应避免铝合金散热器与其他材料混合安装。
   目前市场上有些电子散热器厂家大力宣传其散热器产品“没有焊缝、内腔洁净光滑”等等，其实这对于散热器的抗腐蚀并不能起到作用!因为钢制散热器的腐蚀均不是发生在焊缝上，这是由钢制散热器的腐蚀原理氧腐蚀决定的，所以“没有焊缝或内腔光滑不等于就没有腐蚀”。
   电子散热器内防腐的常用涂料分两类：一类为无机涂料，以锌基铬盐类为代表，像北京森德的“森德无限”防腐散热器;另一类涂料为有机涂料，目前市场上大部分国内品牌的散热器选用这两种有机涂料。还有大部分厂家为了节约成本，省掉了某些处理环节，只做一次内涂处理，涂层厚度一般不超过30微米。因此目前市场上很多做了内涂的散热器，在热水中泡上5天左右便出现大面积起泡，涂层开始剥落。